Самодельный SSL сертификат позволяет работать Вашему сайту по защищённому протоколу HTTPS, но браузеры будут воспринимать Ваш сайт как потенциально опасный и будут предупреждать об этом Ваших посетителей. Зато такой сертификат можно создать за 5 минут. Если Вы делаете сайт на заказ, то в самоподписанном SSL сертификате есть резон.